משימתו העיקרית של מוזיאון היא איסוף, שימור, מחקר וחשיפת התוצרים בפני הציבור במטרה לתרום לשיח תרבותי מדעי. המוזיאונים בקמפוס של 'המכון הישראלי למחקר ופיתוח הפריפריה' יציעו חווית הנאה ולמידה החובקת את שלל תחומי הידע ההיסטורי, התרבותי והאמנותי. זאת באמצעות טיפוח סביבה דינאמית עכשווית המאתגרת את המבקרים להרחיב את הידע בעזרת תערוכות דינמיות הכוללות חוויה הוליסטית של התנסות, בדיקה ולמידה. בהתאם לזאת 'המכון הישראלי למחקר ופיתוח הפריפריה' שואף להפוך את המוזיאונים בקמפוס החדש שייבנה להיכלי מחשבה, השכלה ומחקר.
בקמפוס יהיו מאגרי ידע דיגיטליים שישתלבו עם מרכזי המחקר ויספקו לחוקרים ולציבור הרחב סביבת עבודה אקדמית הוליסטית; כיתות לסדנאות ולימוד; ואודיטוריום להרצאות וימי עיון. בראש מרכזי המחקר יעמדו חוקרים ואנשי אקדמיה מן המעולים בתחומם. החוקרים יהיו שותפים פעילים בחוויה התרבותית-מדעית-היסטורית של חזון המוזיאונים, ומטרתם לתווך את המחקרים העכשוויים ולתרום לקהל הרחב חוויה ייחודית.
בקמפוס החדש של 'המכון הישראלי למחקר ופיתוח הפריפריה יפעלו שלושה מוזיאונים ייחודיים המשלבים למידה והנאה:
