המכון יהווה הגורם האזרחי העצמאי המשפיע ביותר על קביעת מדיניות ממלכתית, השקעות ציבוריות וסדר היום של הממשלות ביחסן לפריפריה בישראל.
'המכון הישראלי למחקר ופיתוח הפריפריה' נועד לייצג את החברה הישראלית על כל גווניה, בה יש השלמה טבעית בין המסורת היהודית לפרויקט הציוני. לקדם מחקר על הפריפריה בישראל באמצעות מרכזי מחקר ופיתוח ייעודיים. לבנות מודלים לפיתוח פריפריות, אשר יסייעו למקבלי ההחלטות בישראל בתכנון מדיניות. לתמוך בתלמידים, סטודנטים והציבור הרחב המעוניינים לרכוש מידע מעמיק א-פוליטי על הפריפריה מאז הקמת המדינה ועד היום. 'המכון הישראלי למחקר ופיתוח הפריפריה' יקים גם מרכזי מבקרים ייחודיים אשר ישקפו את העשייה בפריפריה ויתרמו להעשרת הידע של מתעניינים מרחבי הארץ. ייערכו בהם ביקורים של הקהל הרחב, ימי עיון וכנסים, סדנאות לילדים ונוער. על פי הפרוט להלן:
מוזיאון לתולדות ההתיישבות בפריפריה (מעברות, עיירות פיתוח, קיבוצים, מושבים וחוות בודדים)
מוזיאון להתפתחות מרכזי קדושה ועליות לרגל
גלריה לאומנות פלסטית ודיגיטלית של תושבי הפריפריה
כחלק מהמעטפת החברתית, תרבותית, חינוכית, 'המכון הישראלי למחקר ופיתוח הפריפריה' יפעל גם בתחומים הבאים:
הוצאה לאור של כתב עת אקדמי, ספרים, דוחות מחקר וניירות עמדה
סיורים באתרי קדושה, מורשת וקרבות, ימי חוויה והעשרה לילדים ומבוגרים
הכנת מדד הפריפריה השנתי